Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COPS4Q9BT78 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COPS4Q9BT78 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms