Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms