Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LARP6Q9BRS8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms