Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms