Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms