Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLF1Q9BQI6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms