Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD5Q99666 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD5Q99666 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD5Q99666 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD5Q99666 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD5Q99666 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms