Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSRNP1Q96S65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms