Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS6KC1Q96S38 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KC1Q96S38 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms