Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UIMC1Q96RL1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UIMC1Q96RL1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms