Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CICQ96RK0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CICQ96RK0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms