Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC4A9Q96Q91 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms