Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms