Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP3Q96P20 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLRP3Q96P20 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms