Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOX2Q96NM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms