Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms