Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM20AQ96MK3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM20AQ96MK3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms