Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT6LQ96LI5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6LQ96LI5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms