Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms