Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX27Q96GQ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms