Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED8Q96G25 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED8Q96G25 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms