Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM44Q96DX7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM44Q96DX7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms