Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms