Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRUQ92729 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRUQ92729 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms