Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMO7Q8WWI1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMO7Q8WWI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms