Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2AF1L4Q8WU68 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms