Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MYRIPQ8NFW9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYRIPQ8NFW9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms