Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMIEQ8NEW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIEQ8NEW7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms