Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH13Q8NBN7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH13Q8NBN7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms