Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG16L2Q8NAA4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms