Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms