Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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