Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J9

ZNF664, Zinc finger protein 664, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF664Q8N3J9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF664Q8N3J9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms