Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLNKQ7Z7G1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms