Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms