Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYFIP1Q7L576 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms