Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMUB2Q71RG4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMUB2Q71RG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms