Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYDE1Q6ZW31 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms