Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR3Q6ZT12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms