Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms