Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L2Q6R6M4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms