Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms