Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB12Q6NXP0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB12Q6NXP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms