Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF544Q6NX49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms