Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms