Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL3Q6DD88 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms