Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDR78Q5VTH9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR78Q5VTH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms