Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDLRAD1Q5T700 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms