Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN11Q5T124 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms