Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVEP1Q4LDE5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SVEP1Q4LDE5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SVEP1Q4LDE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SVEP1Q4LDE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SVEP1Q4LDE5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms